با وجود پیشرفت‌های چشم‌گیر سازمان امور مالیاتی در سال‌های اخیر و اجرای پروژه‌های ابتکاری برای جلب رضایت مردم مانند اجرای طرح نشان‌دار کردن مالیات‌ها، این حوزه همچنان با چالش‌هایی مانند مبارزه با فرار مالیاتی،معافیت‌ها و سامانه‌ها مواجه است.؛

تا پایان دی ماه دو هزار و ۲۳۶ مؤدی در فهرست فاقد اعتبار مالیاتی درج و دو هزار و ۵۴۳ مؤدی مشکوک شناسایی شده است.؛

فرار مالیاتی تعدادی از اشخاص از محل فعالیت هفت صندوق‌ قرض‌الحسنه مشکوک به کتمان فعالیت واقعی مشتریان در خراسان رضوی شناسایی شد.؛

به گزارش پایگاه خبری تحلیلی صبح تجارت، در پایان سال ۱۴۰۱ با وصول گزارشات برخی تخلفات و پنهانکاری‌های فعالان اقتصادی در صندوق‌های قرض‌الحسنه اعتباری غیربانکی اداره‌کل مبارزه با فرار مالیاتی و وصول و اجرای ویژه شهر و استان تهران، نسبت به بررسی و بازرسی از ۳ صندوق در استانهای تهران، کرمان و مازندران اقدام کرد.

نکاتی که در خصوص شیوه محاسبه مالیات در رویه وارداتی واردات در برابر صادرات خود و قیمت‌گذاری آیفون‌های وارداتی و ریپک وجود دارد، مربوط به وزارت صمت و سایر دستگاه‌هایی است که در این حوزه مسئولیت دارند.؛