با وجود پیشرفت‌های چشم‌گیر سازمان امور مالیاتی در سال‌های اخیر و اجرای پروژه‌های ابتکاری برای جلب رضایت مردم مانند اجرای طرح نشان‌دار کردن مالیات‌ها، این حوزه همچنان با چالش‌هایی مانند مبارزه با فرار مالیاتی،معافیت‌ها و سامانه‌ها مواجه است.؛